吉祥寺駅の中央線 改札口（構内図で青色）は４か所。
JR東日本の中央線と、京王電鉄による井の頭線が乗り入れる駅です。
| フロア | アトレ本館 | 周辺 | アトレ東館 |
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| ３階 |
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| ２階 |
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| １階 |
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中央線 吉祥寺駅について
駅舎は商業施設《アトレ吉祥寺》と一体です。
中央線の快速と各駅停車、どちらも吉祥寺駅を発着します。
なお、正しい駅名は「吉祥寺駅」ですが、《駅ずかん》では井の頭線と区別するため、一部「JR」を加えて表記しています。
| 鉄道路線 | 中央線（快速・総武線直通 各駅停車） |
|---|---|
| 駅番号 | JC11 JB02 |
| 改札口の数 | ４つ 中央改札・南改札（公園口）・西改札（アトレ本館）・東口（アトレ東館口） |
| 所在地 | 東京都武蔵野市吉祥寺南町1 |
| タクシー乗り場 | ２つ 北口・東口 |
| 周辺施設 | アトレ吉祥寺 キラリナ京王吉祥寺 井の頭公園 |
