JR吉祥寺駅の改札口（構内図で青色）は４か所。
| フロア | アトレ本館 | 周辺 | アトレ東館 |
|---|---|---|---|
| 3階 |
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| 2階 |
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| 1階 |
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JR東日本 吉祥寺駅の基本情報
駅舎は商業施設《アトレ吉祥寺》と一体です。
中央線の快速と各駅停車、どちらも吉祥寺駅を発着します。
なお、駅名は「吉祥寺駅」ですが、《駅ずかん》では井の頭線と区別するため、「JR」を加えて一部表記しています。
| 鉄道路線 （駅番号） | 中央線快速（JC11） 中央・総武線各停（JB02） |
|---|---|
| 改札口の数 | 4つ 中央改札・南改札（公園口）・西改札（アトレ本館）・東口（アトレ東館口） |
| 住所 | 東京都武蔵野市吉祥寺南町1 |
| 隣の駅 | 西荻窪（新宿方面）一部通過 三鷹駅（八王子方面） |
| 周辺施設 | キラリナ京王吉祥寺 井の頭公園 |
