武蔵小杉駅のJR改札口（構内図で青色）は3か所。
| フロア | 北口 改札内 | 周辺 | 東側 改札内 |
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| 2階 |
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| 1階 |
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JR東日本 武蔵小杉駅の基本情報
東西に伸びる南武線ホームと、南北に伸びる横須賀線ほかJR（品鶴線）のホームは、改札内で行き来が可能です。
改札口間は直線距離にして250mほど距離があります。「南口」と「新南口」についても同じくらい離れています。
なお、正式な駅名は「武蔵小杉駅」ですが、東急線と区別するため《駅ずかん》では「JR」を加えて一部表記しています。
| 鉄道路線 [駅番号] | 南武線 [JN07] 横須賀線 [JO15] 湘南新宿ライン [JS15] 相鉄・JR直通線 【特急】成田エクスプレス |
|---|---|
| 改札口 | 計3つ （2階：北改札｜1階：新南改札・綱島街道口）＋臨時入場口 |
| 住所 | 神奈川県川崎市中原区小杉 |
| 隣の駅 | 武蔵中原駅（南武線 立川方面） 向河原駅（南武線 川崎方面） 西大井駅（横須賀線 東京方面） 新川崎駅（横須賀線 久里浜方面） |
